Pomáhal u porodů ve Východním Timoru, na Srí Lance i v Libérii, kde pracoval jako dobrovolník na misích Lékařů bez hranic. V posledních letech usiluje o co nejlepší podmínky pro porody ve FN Ostrava, kde je přednostou Gynekologicko-porodnické kliniky. Díky jeho úsilí tak právě tady jako první v Česku zavedli porodní gauče. Ondřej Šimetka, který říká, že být u porodu je velké privilegium, je aktivní i ve výzkumu.
Podílel se například na mimořádném bádání, v němž český tým jako první na světě prokázal přítomnost mikroplastů v lidské plodové vodě.
