Libor Winkler ze svých soukromých zdrojů dlouhodobě podporuje vědu a umění. Za posledních deset let věnoval přes šedesát milionů korun převážně jako individuální dárce. V roce 2013 se stal mecenášem Nadačního fondu Neuron na podporu vědy, je akcionářem galerie DOX, donátorem nezávislých médií nebo členem dozorčí rady Nadačního fondu proti korupci.
