Lenka Filípková dlouhodobě působila v Evropské komisi na Generálním ředitelství pro rozpočet EU, dosud v rámci instituce vedla oddělení koordinace ročních rozpočtů.
Před časem se na exponovaném Generálním ředitelství pro rozpočet stala ředitelkou a patří tak mezi nejvýše postavené Češky v evropských strukturách.